45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3683 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3683  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  213  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0270  hypothetical protein  52 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840372  normal  0.26913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31970  hypothetical protein  51.52 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  50.51 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  47.52 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  47.19 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0316  hypothetical protein  44.9 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  49 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1021  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4244  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  46.07 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40.95 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4414  hypothetical protein  43 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  44.94 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1199  hypothetical protein  43.43 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2834  hypothetical protein  51.25 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  39.18 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0069  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.138923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.95 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1992  hypothetical protein  39.6 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5215  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40.38 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1954  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  44 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  38.61 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1851  hypothetical protein  46 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00587852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3210  hypothetical protein  36.11 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02180  RelE-like Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.46 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0293585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48840  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  35.24 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  38.2 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31040  hypothetical protein  38.64 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2231  hypothetical protein  39.78 
 
 		 200 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  37.66 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1116  hypothetical protein  39.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  33.02 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  35.35 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1852  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  32.67 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1573  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  32.67 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233615  normal  0.0445761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  39.76 
 
 		 201 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  25.97 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5138  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.36 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517981  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0719  hypothetical protein  52.94 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  31.65 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>