48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1903 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1573  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  58.41 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233615  normal  0.0445761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1852  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  58.41 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  41.96 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02180  RelE-like Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  44.86 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0293585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  44.95 
 
 		 111 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  46.81 
 
 		 122 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  45.57 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5215  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  32.38 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1954  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  48.42 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1199  hypothetical protein  36.36 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4244  hypothetical protein  38.14 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0316  hypothetical protein  41.11 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31970  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1021  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  32.08 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  36.9 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2231  hypothetical protein  37.5 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4414  hypothetical protein  37.11 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3683  hypothetical protein  35.35 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  36.89 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  29.2 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  34.91 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1992  hypothetical protein  39.22 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  39.22 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2834  hypothetical protein  36.59 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0270  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840372  normal  0.26913 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0069  hypothetical protein  38.24 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.138923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1851  hypothetical protein  39.39 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00587852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  33.66 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  27.72 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  29.76 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48840  hypothetical protein  38.78 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  42.11 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5138  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  46.38 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517981  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1116  hypothetical protein  31.37 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3210  hypothetical protein  29.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  43.1 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  34 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>