46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0484 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  52.43 
 
 		 117 aa  114  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  48.65 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  46.79 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1954  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  60.71 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5215  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  49.04 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02180  RelE-like Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  41.35 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0293585  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  49.45 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2231  hypothetical protein  58.75 
 
 		 200 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  46.46 
 
 		 118 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31970  hypothetical protein  48.39 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4244  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0270  hypothetical protein  44.79 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840372  normal  0.26913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  46.08 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  41.51 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  45.05 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  47.25 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  36.04 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  49.37 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4414  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31040  hypothetical protein  44.33 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1199  hypothetical protein  40.95 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  44.33 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  43.3 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  36.61 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2834  hypothetical protein  46.84 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3683  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1021  hypothetical protein  42.35 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0316  hypothetical protein  45.88 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  40.95 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1992  hypothetical protein  40.95 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0069  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.138923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1851  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00587852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  41.76 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  49.4 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1116  hypothetical protein  38.83 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1852  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.84 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1573  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.84 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233615  normal  0.0445761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5138  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  50 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517981  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  39.24 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3210  hypothetical protein  37.04 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48840  hypothetical protein  40.59 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1506  hypothetical protein  38.03 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  28.12 
 
 		 109 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>