19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1506 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1506  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  227  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3187  hypothetical protein  45.63 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1031  hypothetical protein  43.14 
 
 
116 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  48.24 
 
 
149 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0952  hypothetical protein  55.17 
 
 
58 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0166622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5131  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1721  hypothetical protein  28.71 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5434  hypothetical protein  35.29 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  31.68 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0925  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000524962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  38.67 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  46.77 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  40 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  31.37 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.03 
 
 
112 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  36.96 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  47.22 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.55 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  42.19 
 
 
118 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>