33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0094 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  71.43 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  56.16 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  52.54 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  50.82 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  50.82 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  56.25 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  56 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  56 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  52.08 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  47.06 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  49.06 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  49.06 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  49.02 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  36.54 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  42.5 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 		 380 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  32 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  34 
 
 		 60 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  31.03 
 
 		 307 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 291 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0194  DNA binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.741486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>