44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4582 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 1228 aa  2483    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  28 
 
 		 1214 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  24.42 
 
 		 1159 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1140 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.8 
 
 		 1113 aa  125  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1138 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  32.82 
 
 		 1207 aa  106  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  24.19 
 
 		 1107 aa  101  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 		 1109 aa  99.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  31.51 
 
 		 1159 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1145 aa  78.2  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1159 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1159 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1123 aa  66.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1133 aa  64.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1121 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1166 aa  62.4  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  26.64 
 
 		 1124 aa  62  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1141 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.19 
 
 		 1140 aa  59.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1121 aa  58.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.46 
 
 		 1093 aa  58.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1121 aa  58.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1121 aa  58.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1120 aa  56.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1125 aa  55.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1125 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  27.01 
 
 		 1133 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1122 aa  49.7  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  24 
 
 		 1143 aa  48.9  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24 
 
 		 1144 aa  48.9  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  23.52 
 
 		 1388 aa  48.9  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1120 aa  48.5  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1128 aa  48.5  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1120 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1120 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1118 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  28.74 
 
 		 1136 aa  46.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1120 aa  45.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1366 aa  45.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  36.36 
 
 		 1143 aa  45.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  24.46 
 
 		 1124 aa  45.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>