More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4102 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  100 
 
 
138 aa  274  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  65.19 
 
 
135 aa  181  2e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  64.44 
 
 
135 aa  181  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  61.19 
 
 
135 aa  179  8e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  60.74 
 
 
135 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  70.31 
 
 
128 aa  177  5e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  63.7 
 
 
135 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  66.18 
 
 
136 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  62.22 
 
 
135 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  55.15 
 
 
138 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  47.41 
 
 
140 aa  133  1e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  43.28 
 
 
135 aa  118  2e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  44.7 
 
 
151 aa  114  4e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  47.73 
 
 
140 aa  112  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.55 
 
 
141 aa  112  2e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
138 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  44.19 
 
 
137 aa  109  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
140 aa  108  2e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  40.44 
 
 
161 aa  108  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  42.97 
 
 
135 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.15 
 
 
141 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
141 aa  107  7e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  42.19 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  42.19 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  42.19 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  42.19 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  42.19 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  42.19 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  42.19 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  41.41 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  41.41 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  41.41 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  41.41 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  41.41 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  42.19 
 
 
140 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
141 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 
141 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  47.73 
 
 
140 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.09 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.3 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  36.23 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
138 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  33.33 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  35.51 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 
144 aa  83.2  1e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63421e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 
158 aa  83.2  1e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03873e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 
144 aa  82  2e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
151 aa  81.6  3e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 
144 aa  80.9  5e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 
137 aa  80.9  5e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
144 aa  80.5  7e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
144 aa  79.7  1e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
144 aa  80.1  1e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  31.65 
 
 
141 aa  79  2e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  31.65 
 
 
141 aa  79.3  2e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.99 
 
 
142 aa  78.6  3e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  31.39 
 
 
144 aa  77.8  4e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
141 aa  78.2  4e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
144 aa  77.8  4e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  32.12 
 
 
144 aa  77.8  5e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
124 aa  77.8  5e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
124 aa  77.4  6e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
137 aa  77.4  6e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
130 aa  77.4  6e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 
393 aa  77.4  7e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  34.04 
 
 
144 aa  77  8e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  34.81 
 
 
137 aa  76.3  1e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  42 
 
 
102 aa  76.3  2e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
137 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  34.56 
 
 
139 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  34.56 
 
 
139 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.24 
 
 
361 aa  75.5  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  37.12 
 
 
137 aa  75.9  2e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
149 aa  73.9  6e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
149 aa  73.9  6e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.23958e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 
137 aa  73.9  7e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  30.66 
 
 
139 aa  73.6  9e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
121 aa  73.6  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.62843e-08  hitchhiker  2.63083e-06 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  30.43 
 
 
139 aa  73.2  1e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  30.43 
 
 
139 aa  73.2  1e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  33.82 
 
 
248 aa  73.2  1e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  43.37 
 
 
116 aa  73.6  1e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
149 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
123 aa  72.4  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 
144 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 
141 aa  72  3e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  28.68 
 
 
148 aa  71.6  3e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  30 
 
 
137 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
127 aa  71.6  3e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 
127 aa  71.6  4e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.75 
 
 
127 aa  71.6  4e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 
127 aa  71.6  4e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 
127 aa  71.6  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>