More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2811 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  100 
 
 		 624 aa  1273    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  62.27 
 
 		 603 aa  767    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  64.37 
 
 		 592 aa  750    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  59.65 
 
 		 600 aa  732    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  49.25 
 
 		 561 aa  558  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  51.12 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.95 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.6 
 
 		 565 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.77 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.6 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  49.09 
 
 		 583 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.43 
 
 		 565 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  50.6 
 
 		 565 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.6 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.6 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.95 
 
 		 567 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.77 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.43 
 
 		 565 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  50.26 
 
 		 565 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.6 
 
 		 565 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.8 
 
 		 595 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  49.26 
 
 		 583 aa  548  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.8 
 
 		 595 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.8 
 
 		 595 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.71 
 
 		 563 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.43 
 
 		 619 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.77 
 
 		 619 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.77 
 
 		 619 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.1 
 
 		 619 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.68 
 
 		 611 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  47.14 
 
 		 613 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.65 
 
 		 613 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.79 
 
 		 613 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.78 
 
 		 610 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.21 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.17 
 
 		 610 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.59 
 
 		 604 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.92 
 
 		 592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.63 
 
 		 602 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.49 
 
 		 609 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.52 
 
 		 607 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.24 
 
 		 570 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.52 
 
 		 608 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.27 
 
 		 624 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.46 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.54 
 
 		 631 aa  475  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.52 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.14 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.91 
 
 		 789 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.45 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  36.9 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  35.93 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.56 
 
 		 613 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  35.91 
 
 		 750 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  37.09 
 
 		 649 aa  363  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  36.36 
 
 		 630 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  35.58 
 
 		 731 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.9 
 
 		 626 aa  349  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  34.58 
 
 		 625 aa  345  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.72 
 
 		 589 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.69 
 
 		 624 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  36.21 
 
 		 745 aa  340  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  35.61 
 
 		 586 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.55 
 
 		 586 aa  339  8e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  33.39 
 
 		 623 aa  339  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  35.99 
 
 		 632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.95 
 
 		 624 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  35.91 
 
 		 623 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  35.1 
 
 		 642 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  36.82 
 
 		 623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  33.45 
 
 		 603 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.54 
 
 		 752 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.94 
 
 		 616 aa  323  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.94 
 
 		 616 aa  323  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  32.63 
 
 		 654 aa  323  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  36.35 
 
 		 604 aa  323  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.33 
 
 		 606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  32.7 
 
 		 610 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.26 
 
 		 654 aa  320  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  33.17 
 
 		 577 aa  317  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  35.28 
 
 		 577 aa  316  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.59 
 
 		 628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.18 
 
 		 602 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.56 
 
 		 612 aa  312  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  32.46 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  35.71 
 
 		 570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.69 
 
 		 611 aa  303  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.5 
 
 		 612 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.16 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  33.11 
 
 		 600 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.15 
 
 		 590 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  32.5 
 
 		 618 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.11 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.7 
 
 		 563 aa  294  4e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  38.1 
 
 		 608 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.95 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  39.8 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.01 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 590 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>