43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02305 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  77.47 
 
 		 393 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  44.92 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  44.56 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  37.02 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  38.69 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  36.62 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  36.68 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  28.41 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  23.32 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  23.34 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  21.35 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.84 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  24.51 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  22.03 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  23.94 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  22.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  27.23 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  25.97 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  22.89 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  24.27 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  25.1 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.74 
 
 		 933 aa  50.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  22.89 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  22.37 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  25.94 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  23.86 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  22.36 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  22.92 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  21.6 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  23.55 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  23.43 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  28.65 
 
 		 512 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  25.51 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  23.77 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  20.75 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  24.52 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  20.26 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  21.39 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.1 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  22.53 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>