178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004440 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 		 262 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  90.08 
 
 		 272 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  61.92 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  44.74 
 
 		 258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.35 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.05 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.49 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.04 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.91 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.91 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.91 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.54 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.49 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.74 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.49 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.49 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  41.88 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  41.88 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.88 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.88 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.88 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.49 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.12 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  41.88 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.88 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.11 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.45 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.01 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.06 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.06 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.67 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.32 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.4 
 
 		 237 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.4 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.4 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.4 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.4 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.13 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.52 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.7 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.32 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.17 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.81 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  39.17 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.32 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  40.31 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  34.93 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.28 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  34.11 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  37.17 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.2 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  33.74 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  36.73 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  31.51 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  36.89 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  36.17 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  34.48 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  34.42 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.89 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.89 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.14 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  31.25 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.88 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.86 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.44 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  33.98 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.04 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  35.1 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.59 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.59 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  34.13 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.53 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.98 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.03 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.02 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  35 
 
 		 179 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.95 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  26.58 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 178 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  33.04 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.08 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  26.84 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  31.37 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  26.73 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.8 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.23 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  25.57 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.01 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.12 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>