25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000184 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  100 
 
 		 802 aa  1630    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  53.37 
 
 		 796 aa  811    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  37.07 
 
 		 826 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  27.59 
 
 		 827 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  28.15 
 
 		 826 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  27.32 
 
 		 866 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  26.41 
 
 		 828 aa  190  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  27.51 
 
 		 828 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  26.84 
 
 		 827 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  26.65 
 
 		 827 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  26.65 
 
 		 827 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  26.65 
 
 		 827 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  26.86 
 
 		 827 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  25.7 
 
 		 832 aa  178  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  28.74 
 
 		 856 aa  177  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  26.33 
 
 		 828 aa  177  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  26.49 
 
 		 828 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  26.87 
 
 		 824 aa  165  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  28.21 
 
 		 829 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  25.38 
 
 		 872 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  26.11 
 
 		 839 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  27.56 
 
 		 823 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  25.87 
 
 		 993 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  28.83 
 
 		 939 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  31.18 
 
 		 832 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>