More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0258 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
573 aa  1121    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  37.32 
 
 
555 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  38.29 
 
 
556 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 
567 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  35.78 
 
 
567 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 
562 aa  329  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.48 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
567 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  35.28 
 
 
624 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
606 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  36.59 
 
 
568 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  35.1 
 
 
564 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
583 aa  321  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  37.65 
 
 
684 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  37.12 
 
 
575 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  35.67 
 
 
605 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  35.93 
 
 
576 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  34.62 
 
 
563 aa  316  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  34.5 
 
 
563 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 
567 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  34.62 
 
 
563 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 
667 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  34.98 
 
 
605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  34.98 
 
 
605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  35.17 
 
 
562 aa  312  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  34.99 
 
 
558 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 
565 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.99 
 
 
558 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  34.99 
 
 
558 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  34.11 
 
 
566 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  34.99 
 
 
558 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  34.99 
 
 
558 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  34.99 
 
 
558 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  37.89 
 
 
662 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  34.81 
 
 
558 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  34.99 
 
 
558 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  34.99 
 
 
558 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  33.57 
 
 
564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  36.15 
 
 
583 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
567 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  34.81 
 
 
558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 
565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 
595 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  35.41 
 
 
678 aa  306  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  34.26 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  34.26 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  34.26 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
579 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  34.26 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  34.26 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  36.31 
 
 
619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  35.8 
 
 
569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  33.94 
 
 
562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  36.31 
 
 
619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  38.6 
 
 
574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 
775 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  36.2 
 
 
762 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
584 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 
773 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.51 
 
 
588 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  33.64 
 
 
650 aa  302  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  33.76 
 
 
561 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 
771 aa  299  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  36.45 
 
 
577 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  33.39 
 
 
561 aa  297  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
674 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  34.54 
 
 
607 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  34.01 
 
 
607 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
658 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  35.45 
 
 
564 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  34.78 
 
 
585 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  35.82 
 
 
615 aa  293  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 
613 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
672 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  33.64 
 
 
561 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 
598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 
652 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  34.37 
 
 
541 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4672  potassium efflux system protein  34.38 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
636 aa  286  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 
572 aa  286  9e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 
666 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
673 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 
665 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.71 
 
 
697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
665 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 
572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
665 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  32.92 
 
 
572 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3648  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
571 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279447  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.86 
 
 
671 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
674 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  32.56 
 
 
572 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  33.75 
 
 
569 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3291  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 
571 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99669  normal  0.66857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4140  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 
571 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4226  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 
571 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.336088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
741 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>