257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0688 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1736  cytidyltransferase-like protein  42.13 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.355762  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1930  cytidyltransferase-related domain protein  37.16 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.791436  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2337  cytidyltransferase-like protein  38.14 
 
 
238 aa  138  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.022864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0687  cytidyltransferase-like protein  39.18 
 
 
226 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.285167 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2107  cytidyltransferase-like protein  40.21 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1245  cytidyltransferase-like protein  37.56 
 
 
241 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0187562  hitchhiker  0.00542026 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1979  cytidyltransferase-like protein  39.18 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.278192  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2404  cytidyltransferase-related  38.93 
 
 
156 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  51.06 
 
 
139 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  37.98 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  43.59 
 
 
156 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0310  cytidyltransferase-related domain protein  37.39 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.531506  normal  0.452914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  42.37 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0408  hypothetical protein  38.95 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0199555  hitchhiker  0.00270844 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  41.18 
 
 
149 aa  79  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1909  cytidyltransferase-related domain protein  36.21 
 
 
143 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2296  cytidyltransferase-like protein  37.72 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0621  cytidyltransferase-related domain protein  34.82 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  45.26 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  41.67 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  42.71 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2406  cytidyltransferase-related domain protein  34.78 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.508544  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0209  cytidyltransferase-like protein  37.89 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  40.62 
 
 
150 aa  72  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0715  cytidyltransferase-related domain protein  34.21 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2116  cytidyltransferase-related domain protein  29.57 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  38.71 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  45.95 
 
 
151 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  37.61 
 
 
472 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  36.27 
 
 
129 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  34.02 
 
 
132 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  36.63 
 
 
458 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  39.58 
 
 
169 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  38.54 
 
 
495 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  43.08 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  38.46 
 
 
153 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.02 
 
 
132 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  35.05 
 
 
131 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0461  rfaE bifunctional protein  36.3 
 
 
464 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.640202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  31.25 
 
 
131 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  35.05 
 
 
131 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1736  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.46 
 
 
473 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0140952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  35.83 
 
 
163 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  39.78 
 
 
147 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  37.5 
 
 
487 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  37.4 
 
 
461 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1062  cytidyltransferase-like protein  35.11 
 
 
508 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  36.7 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1764  cytidyltransferase-like protein  36 
 
 
501 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  36.11 
 
 
512 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1391  rfaE bifunctional protein  41.75 
 
 
488 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.114301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  41.05 
 
 
455 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  31.07 
 
 
484 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  37.5 
 
 
490 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  33.64 
 
 
485 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  40 
 
 
502 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2543  rfaE bifunctional protein  34.21 
 
 
152 aa  55.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
139 aa  55.5  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  36.46 
 
 
487 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1750  cytidyltransferase-like protein  35.2 
 
 
502 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0715  rfaE bifunctional protein  35.11 
 
 
164 aa  55.1  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.970718  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
127 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3975  rfaE bifunctional protein  38.78 
 
 
562 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  32 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0578  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  34.88 
 
 
461 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.38 
 
 
437 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  27.93 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1286  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  39.8 
 
 
461 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  37.63 
 
 
146 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  34.34 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.79 
 
 
488 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  32.63 
 
 
130 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  38.95 
 
 
501 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  37.5 
 
 
175 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  35.48 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0571  rfaE bifunctional protein  37.86 
 
 
486 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.861357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  38 
 
 
170 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  38.61 
 
 
488 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4360  rfaE bifunctional protein  37.76 
 
 
643 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0405663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  35.71 
 
 
491 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
162 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0176  cytidyltransferase-related  36.08 
 
 
469 aa  52.8  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.984129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0309  putative transferase protein  37.76 
 
 
166 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1969  rfaE bifunctional protein  35.71 
 
 
162 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0537  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35 
 
 
474 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.673885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4443  cytidyltransferase-related domain protein  36.36 
 
 
494 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  33.96 
 
 
457 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.79 
 
 
482 aa  52  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0484  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.29 
 
 
474 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198605  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  34.65 
 
 
163 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  33.03 
 
 
468 aa  52  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3805  cytidyltransferase-related  36.73 
 
 
494 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193104  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.17 
 
 
132 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.17 
 
 
132 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  31.9 
 
 
358 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  34.69 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>