More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1228 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 550 aa  1113    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  72.36 
 
 		 550 aa  813    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 553 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 554 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 560 aa  638    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 559 aa  638    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 550 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 554 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 554 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  65.82 
 
 		 550 aa  731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 550 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 566 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 		 550 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  70.73 
 
 		 550 aa  803    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 		 551 aa  753    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  70.73 
 
 		 550 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 550 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2092  arginyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 551 aa  621  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000567814  normal  0.0511831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 522 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 558 aa  601  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 562 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 556 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0195  arginine--tRNA ligase  50.17 
 
 		 598 aa  566  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 570 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2625  arginyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 554 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1605  arginyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 620 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2358  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 554 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08000  arginyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 556 aa  502  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00405045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 557 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 551 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 561 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 587 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 614 aa  414  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 561 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 563 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 556 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 564 aa  402  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 556 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 556 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 543 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 554 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 560 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 562 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 551 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 598 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 562 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 589 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 575 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 562 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 586 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 564 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 589 aa  379  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 564 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 550 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4517  arginyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.753132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 554 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>