More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1063 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  64.87 
 
 
307 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  61.07 
 
 
296 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  61.07 
 
 
296 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  61.07 
 
 
296 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  59.35 
 
 
291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  56.9 
 
 
291 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  58.91 
 
 
297 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  55.83 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  54.48 
 
 
288 aa  291  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  56.06 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  51.99 
 
 
310 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 
303 aa  235  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 
301 aa  229  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  47.1 
 
 
326 aa  228  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
313 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
311 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
306 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  27.3 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
311 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
705 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  26.87 
 
 
296 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  33.11 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  32.64 
 
 
907 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.3 
 
 
318 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.17 
 
 
652 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
334 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
299 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
336 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.82 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
324 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
310 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
304 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
307 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
293 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
401 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
327 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
387 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
324 aa  105  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.45 
 
 
379 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
298 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
324 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
324 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
312 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
277 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
312 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
330 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
274 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
329 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
361 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
303 aa  99  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
327 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
334 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
341 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  30.26 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  31.08 
 
 
884 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  27.54 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.64 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
307 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
340 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
331 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
306 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
312 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>