33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3213 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  63.01 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  62.41 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  45 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  37.31 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  22.15 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  31.65 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  30.82 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  29.41 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  32.73 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  18.49 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  29.46 
 
 		 115 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  28.12 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  24.11 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  28.47 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  28.47 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  23.9 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  24.31 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  21.54 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  24.32 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  25.61 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  30.08 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  30.38 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  25.38 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  27.95 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  26.15 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  23.36 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  25.53 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  24.07 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>