More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1261 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  100 
 
 		 104 aa  191  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  64.42 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  64.42 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  62.5 
 
 		 104 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  63.46 
 
 		 104 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  70.11 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  60.58 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  59.62 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  57.84 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  52.88 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  53.47 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  53.47 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.47 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.47 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  56.86 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  55 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  60.4 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  50 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  50 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  58.43 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  48.51 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  49.02 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  55.06 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  55.06 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  56.18 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  53.93 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  53.93 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  55 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  43.27 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  55 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  49 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  55.06 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  53.93 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  55.06 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.5 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  50.98 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  50.98 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>