More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1012 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  100 
 
 		 324 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  77.81 
 
 		 323 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  70.9 
 
 		 324 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  71.01 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  72.64 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  67.71 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  66.14 
 
 		 325 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  67.19 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  65.33 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  64.58 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  60.98 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  62.23 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  61.42 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  61.25 
 
 		 325 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  58.95 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  62.42 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  56.79 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  56.79 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  56.79 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  56.04 
 
 		 323 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  56.92 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  56.09 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  56.11 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  53.29 
 
 		 324 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  37.93 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  39.93 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  39.8 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  38.93 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  34.29 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  35.13 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  35.78 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  38.93 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  33.44 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  37.75 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  36.31 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  32.69 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  35.56 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  35.35 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  35.56 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  36.83 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  36.96 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  35.14 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  34.71 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  33.97 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  34.41 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  34.6 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  31.85 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  36.19 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  36.19 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  34.49 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  34.5 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  34.5 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  34.5 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  34.5 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  32.48 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  34.19 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  34.19 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  34.19 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  36.07 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  34.08 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  35.03 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  32.06 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  33.12 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  30.35 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  30.77 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  28.43 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  33.1 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.97 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.49 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30.67 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  32.55 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.66 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  28.85 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  25.52 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  29.8 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  27.67 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.52 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>