More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1818 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  46.38 
 
 
768 aa  637  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  8.77407e-07  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  49.43 
 
 
821 aa  686  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  1.35432e-09 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  73.74 
 
 
785 aa  1068  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  55.47 
 
 
760 aa  806  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  77.65 
 
 
789 aa  1164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  65.49 
 
 
783 aa  947  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  65.49 
 
 
769 aa  972  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  69.54 
 
 
854 aa  1105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  100 
 
 
798 aa  1543  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.64 
 
 
840 aa  635  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  64.94 
 
 
775 aa  942  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  65.49 
 
 
783 aa  946  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  73.16 
 
 
835 aa  1118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  66.79 
 
 
780 aa  970  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  66.88 
 
 
804 aa  1008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  65.16 
 
 
776 aa  965  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  46.86 
 
 
797 aa  636  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  49.18 
 
 
823 aa  685  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  46.7 
 
 
819 aa  641  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  51.32 
 
 
812 aa  721  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  65.49 
 
 
783 aa  947  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  48.61 
 
 
797 aa  650  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.79 
 
 
817 aa  643  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.37415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 
778 aa  639  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  68.58 
 
 
778 aa  1017  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  44.94 
 
 
810 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  45.98 
 
 
793 aa  632  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.72 
 
 
823 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  4.8524e-08 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  45.02 
 
 
792 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.84 
 
 
806 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  46.5 
 
 
768 aa  628  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.74 
 
 
817 aa  626  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.82753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 
817 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  44.73 
 
 
880 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  44.12 
 
 
794 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93647e-11 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  49.19 
 
 
802 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  44.12 
 
 
794 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 
816 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  46.02 
 
 
817 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 
774 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 
815 aa  621  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  2.34366e-07  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  45.63 
 
 
812 aa  622  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  43.5 
 
 
815 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  44.91 
 
 
781 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.52333e-05  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 
823 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  44.64 
 
 
783 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  46.39 
 
 
805 aa  620  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.89 
 
 
776 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  45.09 
 
 
773 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  45.56 
 
 
774 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  3.39276e-14 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  47.04 
 
 
797 aa  619  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.64 
 
 
776 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.91 
 
 
785 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.36 
 
 
784 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.12483e-07  hitchhiker  7.16976e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 
786 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.77 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.03757e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.89 
 
 
776 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.65 
 
 
776 aa  615  1e-174  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.8 
 
 
793 aa  614  1e-174  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  48.37 
 
 
788 aa  615  1e-174  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.77 
 
 
776 aa  614  1e-174  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  43.32 
 
 
786 aa  613  1e-174  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.93183e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.78 
 
 
776 aa  614  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.88 
 
 
787 aa  615  1e-174  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  45.29 
 
 
804 aa  614  1e-174  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  45.3 
 
 
828 aa  613  1e-174  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  45.29 
 
 
804 aa  614  1e-174  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.54 
 
 
775 aa  613  1e-174  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.6135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  43.44 
 
 
783 aa  615  1e-174  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.64 
 
 
773 aa  615  1e-174  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.37635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.24307e-06  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  45.55 
 
 
785 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.7236e-06  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.12 
 
 
784 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.32 
 
 
785 aa  612  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.23975e-05  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 
785 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.14531e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  43.59 
 
 
816 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.72446e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  43 
 
 
784 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.01207e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.03 
 
 
784 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.188e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.03 
 
 
784 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.03 
 
 
784 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.03 
 
 
784 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  44.91 
 
 
784 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.76039e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  45.17 
 
 
806 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  45.1 
 
 
785 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.41636e-06  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.68 
 
 
793 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.4 
 
 
773 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.12 
 
 
784 aa  612  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.93102e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  48.57 
 
 
802 aa  612  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  45.29 
 
 
785 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.73516e-06  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  45.29 
 
 
785 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  45.27 
 
 
843 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.03 
 
 
784 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 
785 aa  611  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.02601e-05  hitchhiker  7.06703e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.67472e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.16404e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 
784 aa  609  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.29427e-13  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>