More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0001 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  90 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  96 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  87.93 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0102  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00845186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0062  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00713608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>