More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0042 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
107 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  70.09 
 
 
110 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  62.5 
 
 
113 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  60.38 
 
 
110 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  60.58 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  62.64 
 
 
115 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  55.77 
 
 
109 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  55.45 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  60.87 
 
 
118 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  51.92 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  53.61 
 
 
107 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  50.52 
 
 
107 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  53.92 
 
 
111 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  49.5 
 
 
108 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  51.96 
 
 
108 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  52.94 
 
 
111 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  54.17 
 
 
111 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  50.49 
 
 
116 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  50.49 
 
 
116 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  49.51 
 
 
116 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  51.09 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 
116 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
113 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.93 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.73 
 
 
108 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  52.22 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  48.04 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  50 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  44.23 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  51.65 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  40 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  42.22 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  50.62 
 
 
356 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 
356 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  47.13 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.11 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  48.15 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  43.01 
 
 
471 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  39 
 
 
470 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  43.48 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.75 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  45.21 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.39 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  37.78 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.74 
 
 
562 aa  70.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.38 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  45.33 
 
 
565 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  42.53 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  36.56 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  40.26 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.67 
 
 
566 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.67 
 
 
566 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  36.84 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.59 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  37.8 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  36.59 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 
478 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
101 aa  67  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 
464 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  38.96 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  38.96 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  38.96 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  38.96 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 
478 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
216 aa  66.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  36.67 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  34.78 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>