107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0062 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0062  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0917  translation initiation factor SUI1  42.67 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00387468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  33.7 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0909  translation initiation factor SUI1  43.48 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000312588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.42 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  40.85 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  40.66 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  35 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  35.14 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  33.78 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  35 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0905  translation initiation factor SUI1  40.58 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.348885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0860  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.58 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0600525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  33.78 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  30.68 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  35.53 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  35.29 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  31.46 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  33.78 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  39.58 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  41.76 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  34.12 
 
 		 105 aa  48.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  33.33 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  42.19 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  32.22 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  32.22 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  38.75 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  37.04 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  43.06 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  43.48 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  34.88 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  40 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  33.68 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  32.22 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  34.38 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.93 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  34.38 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  34.38 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  34.38 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  36.07 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  34.29 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  32.53 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  32.22 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.67 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  34.94 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  34.38 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  32.88 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  34.94 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  34.94 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  37.97 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  38.46 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  47.62 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  35.71 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  35.71 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  37.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  42.03 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  40.58 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  35.37 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  43.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  37.36 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  37.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  38.82 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  39.24 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  37.97 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  34.78 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  37.97 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  35.71 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  36.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  36.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  36.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  36.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  36.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  29.91 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  34.78 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  36.17 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  33.68 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  34.09 
 
 		 102 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  36.71 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  30 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  34.62 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  38.78 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  32.35 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  45.24 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>