More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2023 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 142 aa  293  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  56.74 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  45.39 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  40.85 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.91 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.38 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.15 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.15 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  40 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  38.57 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  41.48 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  35.92 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  35.92 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  37.59 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.23 
 
 		 220 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  30.99 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  30.99 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  30.99 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  43.81 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  36.88 
 
 		 141 aa  93.6  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  32.88 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  40.95 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  29.5 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  34.04 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  34.04 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  45.05 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 		 269 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  35.2 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  43.56 
 
 		 480 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  28.37 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32.37 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.61 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  47.78 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.57 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  34.4 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  26.95 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  45.87 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.86 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  32.59 
 
 		 136 aa  84.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  26.95 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  26.95 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 476 aa  84.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  26.95 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  30.66 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  40.35 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  29.08 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>