63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0904 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
128 aa  259  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  52.94 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  49.19 
 
 
125 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  37.04 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  44 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  36.43 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.69 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  47.67 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.85 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.02 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  32.03 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  28.95 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  28.07 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2624  hypothetical protein  36.46 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718341  normal  0.010851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0521  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  36.97 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  37.93 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  30.97 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  24.35 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  29.09 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.08 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.4 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  32.28 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.9 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.01 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.58 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  32.04 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.65 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.15 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  31.88 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2136  hypothetical protein  27.19 
 
 
636 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  34.75 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.69 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  34.55 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  30.77 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  27.52 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.69 
 
 
132 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  32.23 
 
 
636 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  27.1 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  26.17 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.7 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.91 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.92 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.62 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.63 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.91 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.14 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.27 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1013  hypothetical protein  32.84 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  26.36 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.12 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.35 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.34 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.1 
 
 
130 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.3 
 
 
141 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.15 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.43 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  32.43 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.61 
 
 
288 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>