22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2336 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  58.54 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0714  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  44.26 
 
 
126 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4993  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  51.59 
 
 
132 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2575  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  40.52 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05060  hypothetical protein  43.55 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3632  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  35.2 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3193  hypothetical protein  31.71 
 
 
130 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000168358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2104  hypothetical protein  36.94 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.66365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  31.5 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.79 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
145 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  32.03 
 
 
636 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  32.81 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.01 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  30.16 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.32 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.56 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  28.7 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  28.7 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.36 
 
 
140 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  28.36 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>