56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5602 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
140 aa  278  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.09 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.71 
 
 
146 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.31 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.59 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  46.51 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.97 
 
 
145 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.81 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  45.74 
 
 
129 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.06 
 
 
145 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  42.19 
 
 
143 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.81 
 
 
143 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.81 
 
 
143 aa  103  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  40.62 
 
 
144 aa  103  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  41.73 
 
 
143 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.75 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  44.62 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.84 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.35 
 
 
165 aa  96.7  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  32.84 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.75 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.81 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  40 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.69 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  37.98 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  39.23 
 
 
140 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  37.01 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.41 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  30.28 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  35.43 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.23 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.57 
 
 
151 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  37.98 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.46 
 
 
143 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.97 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.23 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.56 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.29 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  40.15 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.21 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.2 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.08 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.57 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.88 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.13 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.25 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.34 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  36.47 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  27.91 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  33.6 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  27.64 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.36 
 
 
134 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  27.64 
 
 
137 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>