50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4240 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  273  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  90.24 
 
 		 137 aa  225  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  35.77 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  38.85 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.85 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  39.5 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  37.88 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.32 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.72 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.01 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  27.34 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  38.26 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.57 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.94 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.94 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.43 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  36.29 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.48 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.83 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.52 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.97 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.22 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.89 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.89 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.12 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.83 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.23 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.71 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.73 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.01 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.3 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.45 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  26.36 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.04 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.95 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.23 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.91 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.35 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.56 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.66 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.56 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.65 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.08 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.69 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.15 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.41 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>