43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0117 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.2 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.28 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  41.74 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.63 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.05 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.42 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.34 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.51 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  25.93 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.67 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.3 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.27 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.97 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.62 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  30.91 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.24 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  21.93 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.75 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.63 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.58 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.08 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.03 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  32.71 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.04 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.6 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.61 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.61 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.04 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  29.57 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>