63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0724 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  91.61 
 
 
143 aa  278  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  90.21 
 
 
143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  86.62 
 
 
145 aa  257  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  64.96 
 
 
148 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  44.78 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  47.76 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  43.85 
 
 
148 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  45.11 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.18 
 
 
147 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.28 
 
 
165 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  48.46 
 
 
138 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  43.08 
 
 
135 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  42.19 
 
 
141 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.62 
 
 
133 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.86 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  39.39 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  39.85 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.81 
 
 
145 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.81 
 
 
140 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.28 
 
 
129 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  41.98 
 
 
143 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.36 
 
 
176 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.28 
 
 
129 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  37.21 
 
 
140 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  37.21 
 
 
140 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.96 
 
 
159 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.43 
 
 
152 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.08 
 
 
156 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.8 
 
 
149 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.21 
 
 
140 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  39.06 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  37.98 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.21 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.88 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  33.59 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.8 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.6 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.11 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.59 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.81 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.81 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.33 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.71 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.71 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  36.17 
 
 
184 aa  82  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  30.43 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  27.13 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  27.13 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  31.82 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.89 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.66 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  23.26 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  30.08 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49685  predicted protein  28.04 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0156674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.68 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3618  hypothetical protein  27.12 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0714  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  26.56 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>