57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1956 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
131 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  51.13 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  45.8 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  47.37 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  48.46 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.75 
 
 
147 aa  127  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  46.46 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  54.26 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.15 
 
 
165 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  48.09 
 
 
134 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.86 
 
 
176 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.86 
 
 
148 aa  119  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.19 
 
 
145 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.75 
 
 
129 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.92 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.86 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.97 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.84 
 
 
133 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.15 
 
 
138 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  46.09 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.53 
 
 
143 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.31 
 
 
143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  41.86 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  40.16 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.35 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.92 
 
 
152 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  41.41 
 
 
135 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.98 
 
 
131 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.15 
 
 
145 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  35.38 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.64 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.6 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  37.8 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.72 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.15 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  34.65 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  34.65 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.94 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.86 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.59 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  39.55 
 
 
184 aa  83.6  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.03 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.28 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.59 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.54 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  29.77 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  29.77 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  31.76 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  31.58 
 
 
137 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  29.82 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.75 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  26.72 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.2 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.21 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.21 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>