61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2536 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 156 aa  316  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  49.23 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  42.45 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  44.62 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  43.85 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  42.64 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.27 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.62 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  37.91 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.8 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.08 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.38 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  42.31 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.54 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.75 
 
 		 140 aa  97.1  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.31 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.31 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.69 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.54 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  34.72 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.55 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.53 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  45.38 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.94 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  38.94 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  38.94 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.84 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.26 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.99 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.38 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.38 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.1 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.1 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  36.15 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.07 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  37.96 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.79 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.38 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.21 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.54 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  39.51 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.61 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  23.66 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  23.66 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  24.43 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.62 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2042  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.09 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.588451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  31.15 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  31.15 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  34.33 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  29.17 
 
 		 135 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  27.43 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4311  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.46 
 
 		 117 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>