31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3400 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
140 aa  291  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3618  hypothetical protein  58.59 
 
 
141 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3870  hypothetical protein  57.36 
 
 
137 aa  161  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.260324  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  49.64 
 
 
138 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  52.76 
 
 
142 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  55.04 
 
 
134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.13 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  34.43 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.06 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.54 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  28.57 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.89 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.44 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.77 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.48 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.89 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  23.93 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  27.97 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.81 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.78 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  25.98 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.21 
 
 
148 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.84 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3315  hypothetical protein  30.51 
 
 
801 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194835  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.73 
 
 
145 aa  40.8  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  40.8  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  27.83 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  27.27 
 
 
636 aa  40  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>