33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3618 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3618  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  293  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3870  hypothetical protein  63.49 
 
 
137 aa  183  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.260324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  61.07 
 
 
142 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  61.07 
 
 
138 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  62.12 
 
 
134 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  58.59 
 
 
140 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.04 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  27.5 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  32.23 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.87 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  28.33 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.67 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.67 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.81 
 
 
143 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.55 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.2 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.72 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3193  hypothetical protein  23.62 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000168358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  29.06 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.1 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  28.21 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.1 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.12 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.62 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  25.62 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.5 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  26.96 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  26.89 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.73 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.93 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.64 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>