38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3987 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
134 aa  286  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  73.28 
 
 
142 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  73.85 
 
 
138 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3618  hypothetical protein  62.12 
 
 
141 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3870  hypothetical protein  55.97 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.260324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  55.04 
 
 
140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.45 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  27.5 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  31.03 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  31.9 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  34.15 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  32 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.23 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.51 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.01 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  31.4 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.4 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  30.58 
 
 
135 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  26.5 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.66 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  30.25 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  30.25 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.66 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.2 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.58 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.25 
 
 
145 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.33 
 
 
152 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.89 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.5 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  30.08 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.67 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3193  hypothetical protein  23.81 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000168358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.97 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  30.51 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.58 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>