50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  90.24 
 
 		 137 aa  225  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.13 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  36.59 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  41.18 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.55 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.72 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.32 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  28.45 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.82 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.79 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.82 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.77 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.96 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.69 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.59 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.05 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.88 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.59 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.46 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.36 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.05 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.83 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.74 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.65 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.17 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.82 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.51 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.58 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.48 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  32.17 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.61 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.66 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.65 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.2 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  24.58 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.2 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.78 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  35.96 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.87 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.15 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.64 
 
 		 140 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>