61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1837 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 143 aa  297  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  90.21 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  90.21 
 
 		 143 aa  270  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  85.82 
 
 		 145 aa  251  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  64.44 
 
 		 148 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  44.78 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  44.53 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  45.52 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.65 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  47.66 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.54 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  41.86 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  48.46 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.77 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  42.31 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  40.6 
 
 		 134 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.31 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.77 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  42.64 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.06 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.81 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.28 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.19 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.65 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.65 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  39.06 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.11 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  37.98 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  37.98 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.98 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.41 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.31 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.89 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  32.81 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.17 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.35 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.38 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.25 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  34.88 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.25 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.8 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.03 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  34.75 
 
 		 184 aa  84.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.85 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4240  hypothetical protein  27.83 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  29.06 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0696  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117478  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0677  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.25 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3400  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3987  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  31.91 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3618  hypothetical protein  28.81 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49685  predicted protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0156674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  23.26 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  26.98 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>