36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6276 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  246  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  58.54 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0714  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  47.58 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4993  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  57.5 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2575  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  41.67 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3632  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  40.17 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05060  hypothetical protein  44.26 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2104  hypothetical protein  44.09 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.66365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4311  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.96 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3193  hypothetical protein  35 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000168358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.65 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.45 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.71 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.84 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.4 
 
 		 145 aa  47.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  36.07 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  31.78 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.08 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  29.1 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.4 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.6 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.89 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  35.2 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.91 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.6 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.97 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  23.2 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.98 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.71 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.33 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.23 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.52 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.88 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  20 
 
 		 147 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>