18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0714 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0714  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  47.58 
 
 
125 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.26 
 
 
134 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4993  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.2 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2575  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  35 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3632  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  36.72 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05060  hypothetical protein  36.89 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3193  hypothetical protein  28.35 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000168358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.48 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2104  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.66365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  28.24 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.34 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.26 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.06 
 
 
152 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.56 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.8 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>