48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2214 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  289  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  289  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  67.65 
 
 
136 aa  215  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.01 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.64 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  33.04 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.82 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  31.53 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.53 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  28.12 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.38 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  28.12 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  30.17 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.77 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.12 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  28.24 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.66 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.85 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  25.38 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  27.69 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.82 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.68 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.13 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.62 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.91 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  30 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.36 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  27.69 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.13 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.3 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.46 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.13 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.36 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.03 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  29.66 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04870  hypothetical protein  26.67 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49685  predicted protein  26.74 
 
 
193 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0156674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.71 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.27 
 
 
131 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.83 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  26.55 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.37 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.91 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.08 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.21 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>