21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49685 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49685  predicted protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0156674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.63 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.63 
 
 
129 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.71 
 
 
129 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.78 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  39.56 
 
 
129 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  26.74 
 
 
137 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  26.74 
 
 
137 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.41 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.04 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  34.41 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.57 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.48 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.56 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.39 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.21 
 
 
148 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.78 
 
 
149 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.07 
 
 
140 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>