13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2136 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  56.13 
 
 		 636 aa  780    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1304    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  24.12 
 
 		 613 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  24.12 
 
 		 613 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  24.01 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  22.54 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  22.54 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  22.54 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  23.23 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  23.23 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3315  hypothetical protein  28.1 
 
 		 801 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  28.95 
 
 		 124 aa  43.9  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  26.53 
 
 		 319 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>