158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0642 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  100 
 
 		 363 aa  741    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  68.82 
 
 		 360 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  44.35 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  44.35 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.44 
 
 		 530 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.78 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.73 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.33 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  33.6 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  29.93 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  29.93 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.54 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.33 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  30.36 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.6 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  26.2 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.67 
 
 		 273 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  30.08 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.52 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.48 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.3 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  29.43 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2721  lipoate-protein ligase A, putative  25.58 
 
 		 510 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2343  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.58 
 
 		 510 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855949  hitchhiker  0.000773035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.3 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  27.82 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.81 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.44 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  27.72 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  27.86 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  27.84 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  28.24 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  28.24 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  28.24 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  28.24 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  28.11 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  28.24 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.34 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.8 
 
 		 261 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  28.24 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  27.99 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.48 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  29.15 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.59 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.59 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  29.21 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.11 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  26.5 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.95 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.6 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.46 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.13 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.76 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.1 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.15 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.39 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  28.27 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.51 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.45 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.54 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.45 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.63 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  28.21 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  30.51 
 
 		 325 aa  86.7  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  29.28 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  28.52 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.36 
 
 		 276 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.36 
 
 		 276 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.72 
 
 		 278 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.6 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  28 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  28.47 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  26.22 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  28.57 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  29.96 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  29.96 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  29.96 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  22.22 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  35.36 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  26.03 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.05 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  29.69 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.99 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.6 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  29.84 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.672461 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.79 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.43 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.43 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  27.76 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.47 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>