241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0749 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  100 
 
 		 1244 aa  2562    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  32.16 
 
 		 1191 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  32.41 
 
 		 1288 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  32.76 
 
 		 1261 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  30.62 
 
 		 1222 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  30.64 
 
 		 1193 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  36.01 
 
 		 1259 aa  773    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  32.58 
 
 		 1290 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  32.98 
 
 		 1253 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  32.96 
 
 		 1263 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  31.5 
 
 		 1406 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  31.5 
 
 		 1426 aa  688    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  35.9 
 
 		 1258 aa  780    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  36.19 
 
 		 1255 aa  795    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  28.89 
 
 		 1453 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  31.23 
 
 		 1222 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  30.25 
 
 		 1409 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  33.74 
 
 		 1237 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  35.86 
 
 		 1244 aa  810    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  37.26 
 
 		 1256 aa  786    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  36.39 
 
 		 1220 aa  734    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  31.15 
 
 		 1238 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  31.11 
 
 		 1205 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  33.59 
 
 		 1247 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  31.04 
 
 		 1266 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.91 
 
 		 1213 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.31 
 
 		 1302 aa  659    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  31 
 
 		 1444 aa  635  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  30.69 
 
 		 1435 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  31.46 
 
 		 1298 aa  629  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  33.08 
 
 		 1247 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  30.31 
 
 		 1196 aa  629  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  30.71 
 
 		 1269 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  30.31 
 
 		 1207 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  30.35 
 
 		 1209 aa  622  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  29.87 
 
 		 1304 aa  621  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  31.59 
 
 		 1203 aa  622  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  30.38 
 
 		 1194 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 		 1269 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 		 1269 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  33.4 
 
 		 1267 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  33.63 
 
 		 1269 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  31.18 
 
 		 1267 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  33.33 
 
 		 1269 aa  618  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  32.49 
 
 		 1207 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  30.25 
 
 		 1281 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  30.23 
 
 		 1199 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  30.16 
 
 		 1206 aa  614  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  30.25 
 
 		 1281 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  30.06 
 
 		 1198 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  30.17 
 
 		 1198 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  30.17 
 
 		 1198 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  30.17 
 
 		 1281 aa  612  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  29.99 
 
 		 1257 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  29.02 
 
 		 1248 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  33.4 
 
 		 1270 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  29.56 
 
 		 1248 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  33.17 
 
 		 1270 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  30.03 
 
 		 1190 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  34.03 
 
 		 1220 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  34.03 
 
 		 1220 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  33.37 
 
 		 1278 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  33.83 
 
 		 1220 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  34.03 
 
 		 1220 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  29.61 
 
 		 1254 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  30.01 
 
 		 1254 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  30.52 
 
 		 1269 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  28.84 
 
 		 1212 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  30.94 
 
 		 1293 aa  595  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  30.59 
 
 		 1364 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  30.42 
 
 		 1273 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  29.99 
 
 		 1253 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  30.1 
 
 		 1253 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  29.05 
 
 		 1253 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  30.02 
 
 		 1253 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  30.69 
 
 		 1293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  28.86 
 
 		 1248 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  30.01 
 
 		 1285 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  30.58 
 
 		 1240 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  30.11 
 
 		 1273 aa  576  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  31.12 
 
 		 1266 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  30.71 
 
 		 1291 aa  572  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  30.4 
 
 		 1260 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.98 
 
 		 1270 aa  555  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  32.03 
 
 		 1175 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  31.1 
 
 		 1343 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  28.88 
 
 		 1235 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  31.57 
 
 		 1229 aa  545  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  31.04 
 
 		 1330 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  32 
 
 		 1256 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.5 
 
 		 1192 aa  538  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  31.1 
 
 		 1249 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  29.8 
 
 		 1263 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  30.34 
 
 		 1239 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.79 
 
 		 1262 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  29.8 
 
 		 1286 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  28.07 
 
 		 1247 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  30 
 
 		 1245 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.52 
 
 		 1297 aa  533  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  29.23 
 
 		 1259 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>