More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0387 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0387  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 102 aa  199  9e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  47.96 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  48.45 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  47.42 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 		 98 aa  99.4  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  47.96 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  46.94 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  46.32 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 98 aa  94.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  45.26 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  41.84 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  43.88 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  41.49 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 97 aa  90.5  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  43.69 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  39.39 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  43.43 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  46.67 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  41.05 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  41.05 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  43.75 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  45.92 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  43.88 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  41.05 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  44.09 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>