51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11062 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3053  hypothetical protein  39.43 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.634225  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  40.36 
 
 
303 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3281  hypothetical protein  36.46 
 
 
192 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1071  hypothetical protein  35.94 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22570  hypothetical protein  37.41 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0454  hypothetical protein  48.04 
 
 
180 aa  72  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.975881  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02720  hypothetical protein  29.94 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  39.26 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  38.56 
 
 
304 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  38.85 
 
 
306 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05460  hypothetical protein  38.53 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  29.93 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  28.92 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25030  hypothetical protein  32.78 
 
 
229 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  31.82 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  30.22 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  31.82 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  27.66 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  28.47 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3085  hypothetical protein  28.32 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  30.94 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  27.86 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  25.74 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  27.54 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  35.97 
 
 
285 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  31.07 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  27.33 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  30.88 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  42.31 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  29.08 
 
 
200 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  28.26 
 
 
205 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4917  hypothetical protein  29.69 
 
 
224 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  32.03 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  33.13 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  34.64 
 
 
306 aa  45.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  25.81 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  34.17 
 
 
285 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  28.86 
 
 
331 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  29.89 
 
 
311 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.61 
 
 
303 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  27.67 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  39.74 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  32.43 
 
 
325 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  34.75 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  27.86 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>