55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10315 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  337  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  70.47 
 
 
152 aa  230  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  70.47 
 
 
159 aa  229  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  68.92 
 
 
168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  67.11 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  67.11 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  68.46 
 
 
154 aa  201  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  59.03 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  48.65 
 
 
160 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  36.62 
 
 
187 aa  84.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  32.85 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  39.85 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  35.77 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  38.64 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  34.31 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  32.31 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  30.83 
 
 
140 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  30.83 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  30.83 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  34.13 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  30.07 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  34.13 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  28.15 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  33.06 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  31.2 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  29.84 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.06 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  31.75 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  24.48 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  33.9 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  33.9 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  25.71 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  33.6 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  33.05 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  27.61 
 
 
138 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  31.76 
 
 
156 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  24.83 
 
 
141 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  24.83 
 
 
141 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  28.06 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.21 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.53 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.71 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.91 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  28.03 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>