45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1906 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  35.77 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.77 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  39.64 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.6 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  36.89 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.85 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  33.2 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  31.56 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  35.59 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  31.86 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  31.6 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  36.19 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  35.68 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.86 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  31.51 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.05 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  42.11 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  22.13 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.93 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.19 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  28.69 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  25.89 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  25.89 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  30.56 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  26.67 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  21.62 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  29.37 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  20.78 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.01 
 
 		 433 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  21.81 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.93 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  23.15 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.15 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  26.04 
 
 		 436 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  26.04 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  31.43 
 
 		 443 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.28 
 
 		 434 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.28 
 
 		 434 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  30.28 
 
 		 434 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.17 
 
 		 468 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  36.07 
 
 		 475 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  29.91 
 
 		 464 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>