24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3276 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  212  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  53.61 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.61 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  52.08 
 
 
251 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.96 
 
 
248 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.04 
 
 
260 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  47.92 
 
 
243 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  45.65 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  42.11 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  35.42 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  35.42 
 
 
267 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  39.18 
 
 
237 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  41.05 
 
 
237 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.14 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  36.46 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  35.96 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  35.92 
 
 
259 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  36.17 
 
 
256 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  33.8 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  26.53 
 
 
253 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  25.71 
 
 
256 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  25.71 
 
 
256 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>