65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0223 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  57.26 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60.17 
 
 
243 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  60.17 
 
 
243 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  50.41 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  51.68 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  35.65 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  35.04 
 
 
257 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  34.5 
 
 
256 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  34.5 
 
 
256 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3835  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.83 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.834498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4001  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.83 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0474  putative peptidyl-prolyl isomerase  27.39 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139387  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0928  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.39 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.79 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  27.47 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.59 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.42 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.17 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.36 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  24.17 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.39 
 
 
359 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.69 
 
 
355 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  30.51 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  24.23 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.92 
 
 
354 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1922  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PpiC-type  39.39 
 
 
701 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  28.38 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  23.38 
 
 
332 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.42 
 
 
349 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0340  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.44 
 
 
700 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  23.87 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.62 
 
 
701 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1980  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.64 
 
 
317 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  24.31 
 
 
267 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5022  hypothetical protein  22.46 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.28 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2988  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.13 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0133874  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  20.85 
 
 
321 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.03 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1532  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.69 
 
 
646 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.287828  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  24.09 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1209  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PpiC-type  32.29 
 
 
697 aa  45.4  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.62 
 
 
301 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.21 
 
 
493 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  24.6 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4068  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.44 
 
 
600 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000254866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  24.3 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  21.93 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0268  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.55 
 
 
631 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  21.32 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0289  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.92 
 
 
384 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2608  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.21 
 
 
705 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.35 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.93 
 
 
355 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1865  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.87 
 
 
646 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.721225  hitchhiker  0.000258425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1070  peptidylprolyl isomerase  26.44 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  26.53 
 
 
102 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0809  peptidylprolyl isomerase  25.84 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0583  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
667 aa  42.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000501806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 
437 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1715  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase transmembrane protein  25.98 
 
 
648 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0289129  normal  0.110727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>