36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0634 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  65.82 
 
 
237 aa  328  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  58.65 
 
 
237 aa  297  9e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.9 
 
 
260 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  34.75 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.75 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.22 
 
 
248 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  32.34 
 
 
251 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  31.86 
 
 
246 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  33.82 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  31.84 
 
 
261 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  29.41 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  35.9 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  27.88 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  36.29 
 
 
267 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  32.61 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  38.14 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  28 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  23.31 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.99 
 
 
252 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.56 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  28.04 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  24.68 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  22.08 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.9 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.06 
 
 
430 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.06 
 
 
446 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.38 
 
 
428 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  29.21 
 
 
311 aa  42  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>